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熒光定量數據分析準則,請參考以下幾點

更新時間:2020-08-25      瀏覽次數:1826

熒光定量數據分析準則,請參考以下幾點

 

熒光定量是通過熒光染料或熒光標記的特異性的探針,對PCR產物進行標記跟蹤,實時在線監控反應過程,結合相應的軟件可以對產物進行分析,計算待測樣品模板的初始濃度。

 

 熒光定量PCR技術是通過熒光染料或熒光標記的特異性探針,對PCR產物進行標記跟蹤,實時監控反應過程。隨著PCR 反應的進行,反應產物不斷累積,熒光信號強度也等比例增加。每經過一個循環,收集一次熒光強度信號,這樣就可以通過熒光強度變化監測產物量的變化,結合相應的軟件對產物進行分析,可以得到熒光擴增曲線,計算待測樣品初始模版的量。實時熒光定量PCR技術是一次由定性技術向熒光定量定量技術的飛躍,運用該項技術,可以對DNA、RNA樣品進行相對定量、定量和定性分析。 

 

判斷數據的有效性,可以結合擴增曲線,溶解曲線,標準曲線以及NTC(檢驗引物)和NRC(檢驗模板)來分析。

1.擴增曲線應呈現出平滑的S型曲線,起始無擴增,起峰時間正常,由擴增曲線得到的Ct值是判斷實驗成功與否的重要參考,Ct值有一定的可信范圍,臨床檢驗小于33,科學研究小于38,內參基因一般小于20,且樣品間內參的Ct值差不超過1,表明內參基因表達量穩定,復孔Ct值標準偏差不超過0.5;

2.溶解曲線應呈現單峰,峰的寬度較小,NTC和NRC無特異的峰出現;

3.標準曲線的斜率范圍-3.58~-3.10,對應引物的擴增效率范圍90%~110%,R2代表線性擬合度,一般大于0.95;

4.NTC用于判斷反應是否存在模板污染,引物是否特異,是否會形成引物二聚體。NTC狀況是沒有擴增,即擴增曲線和溶5.解曲線與基線重合,沒有Ct值。NTC有擴增的情況下,至少與加入模板體系的Ct值相差5或10以上;

6.NRC用于判斷cDNA模板中是否存在基因組DNA殘留,可以間接反映RNA中基因組DNA污染情況,理想情況下,NRC沒有Ct值,有Ct值的話至少要跟加入cDNA模板體系的Ct值相差5或10以上。